Im Schulamt sind 12,5 Schulräte zusammen mit 17 Verwaltungsangestellten und einem Regierungsamtmann tätig.

Staatliche Schulämter in Bayern werden gemäß Bayerisches Gesetz für das Erziehungs- und Unterrichtswesen gemeinsam von einem Schulaufsichtsbeamten (Fachlicher Leitung) und vom Landrat oder dem Oberbürgermeister (Rechtliche Leitung) geleitet. Das Staatliche Schulamt in der Landeshauptstadt München wird von Frau Bettina Betz (Fachlicher Leitung - Angelegenheiten überwiegend fachlicher Natur) und von Herrn Oberbürgermeister Dieter Reiter (Rechtliche Leitung - Angelegenheiten überwiegend rechtlicher Natur - übertragen an Frau Leitende Verwaltungsdirektorin Julia Streibl) geleitet.

Vom Staatlichen Schulamt als Schulaufsichtsbehörde ist das Referat für Bildung und Sport der Landeshauptstadt München zu unterscheiden. Diese städtische Behörde ist für den Schulaufwand der Schulen (z.B. Gebäude der Schulanlage, Sportstätten, Lehr- und Lernmittel) zuständig.